Профессионально-техническое училище № 137 создано в соответствии с приказом Главного управления профессионально-технического образования г. Ленинграда и Ленинградской области № 201 от 24.04.1980 года на базе предприятий Министерства по атомной энергии – Центрального Конструкторского бюро машиностроения (ЦКБМ) и ВНИИ ЭФА им. Д.В. Ефремова.
В 2005 году Профессиональный лицей № 137 переименован в ГОУ НПО Малоохтинский профессиональный лицей Санкт-Петербурга.
В 2011 году ГОУ НПО Малоохтинский профессиональный лицей Санкт-Петербурга переименовано в ГБОУ НПО Малоохтинский профессиональный лицей Санкт-Петербурга. В 2013 г. переименован в Санкт-Петербургское государственное бюджетное профессиональное образовательное учреждение «Малоохтинский колледж».