Построена как паломнический дом.
В 1923-1929 гг. управление Соловецкого лагеря особого назначения.
После закрытия лагеря в 1939 г. вместе с прочим передана РККФ, в 1940–1957 гг. в распоряжении Учебного отряда Северного флота.
Повреждена пожаром в 1990 г., пребываетв руинированном состоянии.
Церковь свт. Николая Чудотворца (Никольская церковь) с ризницей
Построена на месте каменной церкви 1577-1584 гг., разобранной из-за аварийного состояния вместе с древней монастырской звонницей.
Первый этаж здания — сухие погреба, второй — монастырская ризница, третий — сама церковь.
В советское время сильно обветшала вплоть до угрозы обрушения, восстановлена в 1980-е гг.
Построен как 3-ярусный соборный храм: на первом ярусе в цокольном этаже хозяйственные помещения, на втором — три храма: престольный, посвященный Преображению Господню, и два его придела – Зосимо-Савватиевский в северо-восточной части, Михаило-Архангельский с юго-востока. В 1859 году на месте придела в честь преподобных Зосимы и Савватия был построен Свято-Троицкий Зосимо-Савватиевский собор.
В верхнем ярусе, в угловых башенных надстройках находились еще четыре придела: преподобного Иоанна Лествичника, великомученика Феодора Стратилата, Соборов 12 и 70 Апостолов.
Своды собора опираются на два столпа, восьмигранный световой барабан приближен к алтарной стене. В толще стены устроены камеры и лестницы.
В лагерное время Спасо-Преображенский собор как уникальный памятник архитектуры был объявлен заповедником. Здесь находилось отделение антирелигиозного музея, и располагались экспозиции по иконописи (до 2000 икон) и церковной утвари, а также была представлена коллекция медных гравюр.
Реставрация собора началась в 80-х годах XX века и к началу XXI века завершена. 20 апреля 1990 года здесь прошло богослужение – первое после 70-летнего перерыва.
Построена в память посещения Соловков императором Александром II.
Памятник градостроительства и архитектуры. Объект федерального значения. Номер ЕГРОКН 321220004550546.
Надвратная церковь Благовещения Пресвятой Богородицы
Построена зодчим Трифоном Кологривовым, первоначально в меньших размерах, несла пощипцовое завершение, имела с запада паперть, с севера крыльцо-всход.
Домовая церковь настоятеля с комплексом Святых ворот монастыря.
Перестроена расширением на запад, включая паперть, на месте всхода устроен переход в настоятельский корпус, после пожара 1745 г. перестроено завершение.
В 1925-1937 гг. лагерный музей. Отреставрирована в 1970-е гг., с 1992 г. возобновлены богослужения.